Don José Aldunate propuso para la sociedad chilena un proceso de justicia y reconciliación basado en la interpelación del malhechor, haciéndole ver su crimen, buscando que pudiera reconocerlo, arrepentirse, reparar a las víctimas y así recibir el perdón de Dios.

El reconocimiento del crimen es “lo que nos está faltando”, decía en ese momento. Proponía que “nuestra iglesia” desarrolle “una doctrina teológica y moral consistente sobre la justicia, el perdón y la reconciliación, que destaque la necesidad absoluta del reconocimiento de la verdad y el arrepentimiento y reparación de parte de los responsables”. Su propuesta fue muy relevante para desalentar las propuestas de reconciliación basadas en un “borrón y cuenta nueva” que hacía desaparecer no solamente los crímenes sino también a las víctimas. Su reclamo contra la impunidad se hacía precisamente poniendo en el centro del proceso de reconciliación el reconocimiento del crimen por parte de los responsables y la reparación de las víctimas.